禽类的免疫系统遍布于全身，形成机体的防御网络，抵御病原微生物及其他有害物质侵袭。根据它们的功能，可以分为包括骨髓、胸腺和法氏囊的中枢免疫器官，及包括脾、盲肠、扁桃体、头部相关淋巴样组织（HALT）、支气管相关淋巴样组织 （BALT）及哈德尔氏腺等的外周免疫器官。另外，肝、肾及胰腺等许多器官都有不同的淋巴类细胞分散在实质中；但缺乏功能性淋巴结，可能检查到淋巴小结相关的淋巴管。

 

    禽类的胸腺位于颈部两侧皮下，是一种成对的器官，由6~16个叶组成，沿颈静脉排成一串，形状不规则，鸡的胸腺在胚龄12日前形成，在第4个月时体积zui大，性成熟后开始萎缩退化，是控制T细胞形成的器官，主宰细胞免疫。法氏囊是禽类*的近似圆形的器官，鸡呈梨状，鸭为圆柱状，位于肠末端上部，在泄殖腔的背侧后上方，由一短管与泄殖腔相通，故有人认为法氏囊也是相关淋巴组织，它的主要作用是诱导来自骨髓的干细胞，使其分化成B细胞，主宰禽类的体液免疫。

 

    禽类中，鸡和火鸡未见有典型的淋巴结，鸭和鹅则有两对淋巴结，其结构特点与哺乳动物*不同，特点是淋巴窦位于中央而不是在外周；在盲肠壁内，有一对明显的盲肠扁桃体，是产生抗体的重要场所。鸡的脾脏小而圆，内部结构与哺乳动物相似。哈德尔氏腺是禽类眼窝内的分泌腺之一，亦称副泪腺，腺体中虽有T细胞，但它是以B细胞为主的外周免疫器官。

 

    禽的免疫细胞有T细胞、B细胞、NK细胞和巨噬细胞等。卵黄囊造血干细胞进入胸腺发育成性质不同的具有不同功能的T细胞群体，鸡的T细胞在形态上没有什么特征，必须根据细胞表面*的受体及抗原鉴定它们，如Ia抗原和Fc受体等，鸡的T细胞根据其功能可区分为细胞毒性T细胞（Tc）、抑制性T细胞（Ts）和辅助性T细胞（Th）等，T细胞接触抗原后，会产生可溶性免疫调节蛋白淋巴因子，如淋巴细胞抑制因子和血小板游走抑制因子等。另一部分来源于卵黄囊的造血干细胞进入法氏囊，受囊激素的诱导，发育成B细胞，产生IgM、IgG和IgA，鸡B细胞的表面标志有SmIg和Fc受体，特别SmIg是鉴定B细胞的一个可靠标志。研究发现，禽类的NK细胞发育比较健全，其杀伤活性与年龄有关，新生期动物的NK细胞活性较低，但随年龄的增长而提高。

 

    禽类和哺乳动物一样，亦是通过细胞 免疫 和体液免疫来完成特异性免疫应答。鸡的细胞免疫主要由T细胞、NK细胞和巨噬细胞完成。T细胞在体外对有丝分裂原可发生强烈的应答，介入体内可发生包括同种和异种移植物排斥反应、移植物抗宿主反应、肿瘤免疫及迟发型超敏反应等，禽的T细胞可以完成免疫调节功能，Ts细胞可抑制B细胞产生抗体，Th细胞可辅助B细胞产生抗体；细胞免疫比体液免疫发生的早，接种疫苗后的2~3日即可检出效应T细胞，在1~2周后出现细胞免疫应答高峰，而抗体高峰出现较晚。禽类的体液免疫也有不同于哺乳动物的特点，鸟类血清中的Ig浓度比哺乳动物低，抗体的亲和力也较弱，IgM的含量与IgG比较相对多于哺乳动物，鸟类的Ig不如哺乳类的结构稳定，保存过程中易于变性，这种性质反应了禽类的免疫机构不像哺乳类那样发达，禽类的免疫球蛋白已确认的有IgM、IgG（或称IgY,包括IgG1、IgG2和IgG3三个亚类）和IgA三类，但有报道鸡也有IgD。抗原通过不同途径注入禽体后，可见浆细胞增加、抗体滴度上升，但各类免疫球蛋白的产生有明显的器官差异性，以鸡为例，IgG生成细胞在脾、扁桃体和副泪腺较多，IgM和IgA生成细胞在小肠淋巴结等处较多。